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关于根组织的问题，漩涡花道与波风水门在这之前倒是进行过一番商议，志村团藏的事情现在虽然还没有结束，但是他的那些罪行已经坐实，不久前的木叶高层紧急会议最后也给出了对志村团藏的初步决定，之后波风水门计划将志村团藏的罪行公布于众，虽然这样可能会造成一些消极影响，但是为了更好根除志村团藏的力量还是很有必要的，如此可以得打整个木叶的支持，而不是局限于木叶的高层。
漩涡花道很同意波风水门的安排，将志村团藏的罪行公布于众，不仅可以得到更广范围的支持，也可以提升波风水门在村子里的影响力，对于作为火影的波风水门也是非常有利。
波风水门：“阿道，接管根组织你考虑得这么样？说句实话，你真是我认为适合的人选，其他人我还真不放心。”x33
接管根组织的事情，波风水门之前跟漩涡花道提过，志村团藏的罪行一旦坐实，其中一个极为重要的问题是就是根组织，志村团藏是根组织的领导者，现在对方已经神色并且罪行坐实，其领导者的身份自然是要剥夺，根组织需要新的领导者去接管，而这个新的领导者他觉得漩涡花道是最适合的人选。
波风水门任务漩涡花道最适合的原因有几点：
第一，漩涡花道拥有足够强大的实力却压制根组织成员，那场战斗漩涡花道反杀志村团藏你与击溃两支精英小队以及十二人小队，至少在根组织那些精英忍者面前已经充分展示出了强大的实力，而根组织的接任者需要一个强者。
第二，在积极收集志村团藏罪行这段时间里，漩涡花道对根组织可以说有一个全面了解，那些根组织精英忍者都是漩涡花道策反指证志村团藏，而且他在空之域与那些根组织精英忍者也有所接触，看得出来，其中不少根组织精英忍者对漩涡花道产生一定的信任，如此意味着漩涡已经得到部分根组织精英忍者的认可。
第三是为了根组织的改革，在这之前他与漩涡花道商议过，根组织可以继续存在于木叶，但是必须进行改革，去除掉那些黑暗的东西，光明正大服务于木叶。
第四，根组织虽然被漩涡花道重创，损失不少精英忍者，但是根组织依旧拥有十分强大的力量，根据收集的信息，根组织除了培养出来众多忍者，还拥有极为强大的情报系统，谁去接管根组织是一个非常重要的问题，而他现在最为信任的人不是别人，正是漩涡花道，如果漩涡花道去接任根组织，对他将会更为有利。
当然，除了上述四点原因，波风水门还